NGS接头:DNA 与测序仪的连接桥梁发表时间:2024-01-23 16:45 接头是一段短的碱基序列,作为桥梁连接待测 DNA 片段与 Flow-cell。以 Illumina 测序平台为例,包括三个部分:与 Flow-cell 上寡核苷酸链相同或互补的片段 P5/P7;测序引物结合部分 Read1/2;用于区分不同样本的 Index。 图1. 文库的一般结构 *Index 是混样中不同样本的“身份证”,一般长 6nt 、8nt、或 10nt,四种碱基的不同排列组合可以形成不同的 Index标识。 NGS接头的分类 根据不同测序平台 可分为Illumina接头和MGI接头。 根据Index 位置 可分为单端 Index 接头和双端 Index 接头。单端 Index 接头仅在一端存在 Index(一般在 P7 端);而双端 Index 接头在 P5 和 P7 端均存在 Index。随着测序仪的数据量不断增加,双端 Index 比单端 Index 能容纳更多数目的样本,因此双端 Index 接头被更广泛使用。 图2. 单端Index示意图 图3. 双端Index示意图 根据接头是否匹配PCR free建库 可以将接头分为全长接头和截短型接头。
HRK Adapter & UDI Primer (for Illumina ) HRK Adapter & UDI Primer (for Illumina)是适用于Illumina平台高通量测序的板装双端唯一标签(UDI) 接头试剂,提供Index号为1-96、 97-192、193-288、289-384 四种组合的 UDI序列,能够满足高通量测序平台单条lane超高数据产量的混样需求。还可提供不同规格适配于Illumina平台及MGI平台总计各384种UDI 接头试剂及384种增加了分子标签技术(UMI)的UMI-UDI接头试剂。 Illumina 平台UDI测序文库包含通用序列、i7 Index序列、i5 Index序列和插入片段。 HRK Adapter &UMI Primer (for Illumina) HRK Adapter & UMI Primer (for Illumina)是适用于Illumina平台高通量测序的板装双端唯一标签(UDI) 接头试剂, 提供Index号为 1-96、 97-192、193-288、289-384 四种组合的 UDI序列,能够满足高通量测序平台单条lane超高数据产量的混样需求。还可提供不同规格适配于Illumina平台及MGI平台总计各384种UDI 接头试剂及384种增加了分子标签技术(UMI)的UMI-UDI接头试剂。 Illumina 平台UMI测序文库包含通用序列、i7 Index序列、i5 Index序列、UMI 序列插入片段。 HRK Adapter & UDI Primer (for MGI ) HRK Adapter & UDI Primer (for MGI)是适用于MGI平台高通量测序的板装双端唯一标签(UDI) 接头试剂, 提供Index号为 1-96、 97-192、193-288、289-384 四种组合的UDI序列,能够满足高通量测序平台单条lane超高数据产量的混样需求。还可提供不同规格适配于MGI平台及Illumina平台总计各384种UDI 接头试剂及384种增加了分子标签技术(UMI)的UMI-UDI接头试剂。 MGI 平台UDI测序文库包含通用序列、Index1 序列、Index2 序列和插入片段。 HRK Adapter & UMI Primer (for MGI ) HRK Adapter & UMI Primer (for MGI)是适用于MGI平台高通量测序的板装双端唯一标签(UDI) 接头试剂, 提供Index号为 1-96、 97-192、193-288、289-384 四种组合的 UDI序列,能够满足高通量测序平台单条lane超高数据产量的混样需求。还可提供不同规格适配于MGI平台及Illumina平台总计各384种UDI 接头试剂及384种增加了分子标签技术(UMI)的UMI-UDI接头试剂。 MGI 平台UMI测序文库包含通用序列、 Index1序列、 Index2序列、UMI 序列和插入片段。 咨询相关产品及科研服务 |